Bionano

Bionano Genomics lidera la innovación en mapeo óptico del genoma, ofreciendo soluciones avanzadas para la detección de variaciones estructurales en el ADN. Revoluciona la investigación genética y clínica con precisión y detalle sin precedentes.

Optical Genome Mapping

El Optical Genome Mapping (OGM) es una tecnología avanzada que permite la detección de variaciones estructurales en el genoma. A diferencia de las técnicas de secuenciación de próxima generación (NGS), el OGM utiliza moléculas de ADN ultra-altas en peso molecular (UHMW) que son etiquetadas con fluorescencia y luego linearizadas en nano-canales para obtener imágenes de alta resolución. Este proceso revela variaciones estructurales que pueden ser difíciles de detectar con otras tecnologías.

Pasos del OGM (Optical Genome Maping)

Paso 1: Aislamiento de ADN UHMW
OGM comienza con el aislamiento de ADN de ultra-alto peso molecular (UHMW) a partir de diversas muestras como sangre, tejido, biopsias, etc. El método de preparación de muestras de Bionano produce moléculas grandes necesarias para detectar variaciones estructurales complejas.
Paso 1: Aislamiento de ADN UHMW
Paso 2: Etiquetado de Secuencias Específicas
El flujo de trabajo Bionano DLS etiqueta un motivo de 6 pb en el genoma humano 14-17 veces por cada 100 kbp mediante modificación covalente, creando un patrón de etiquetas específico para ensamblar mapas del genoma.
Paso 2: Etiquetado de Secuencias Específicas
Paso 3: Transferencia del ADN Etiquetado al Chip
El ADN etiquetado se carga en una celda de flujo de un chip, permitiendo la electroforesis de moléculas de entrada a salida.
Paso 3: Transferencia del ADN Etiquetado al Chip
Paso 4: Linearización y Captura de Imágenes del ADN
Las moléculas de ADN se estiran y se imponen en los nano-canales, donde una cámara de alta resolución captura imágenes de estas moléculas linealizadas.
Paso 4: Linearización y Captura de Imágenes del ADN
Paso 5: Conversión de Imágenes a Archivos Moleculares
Los algoritmos convierten los datos de imagen en representaciones digitales del patrón de etiquetas, permitiendo la detección precisa de todas las clases de variantes estructurales.
Paso 5: Conversión de Imágenes a Archivos Moleculares

Beneficios del Optical Genome Maping

Identifica grandes variaciones en el genoma que las técnicas de secuenciación a menudo no detectan.

Ofrece una vista completa y sin sesgos del genoma, esencial para estudios de enfermedades genéticas y cáncer.

Detecta variantes con una fracción alélica variante tan baja como el 1%, permitiendo el análisis de muestras heterogéneas como tumores​.

Saphyr™ System

Descubre el Sistema Saphyr™ de Bionano

El sistema Saphyr™ de Bionano es la herramienta más poderosa para la detección de variantes estructurales del genoma, superando las limitaciones de las tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS) y las técnicas citogenéticas convencionales. Con Saphyr™, puedes detectar rutinariamente todas las clases de variantes estructurales hasta una resolución de 500 pares de bases (bp) y una frecuencia de alelo variante del 5%

Empodera tu laboratorio con la detección avanzada de variantes estructurales utilizando el mapeo óptico del genoma.

El sistema Saphyr™ proporciona mapeo óptico del genoma de ADN de ultra-alto peso molecular (UHMW) en su estado nativo, desde moléculas de 150 kbp hasta pares de bases de varios megabases de longitud.

En tan solo tres días, completa todo el flujo de trabajo desde la muestra hasta la detección de variaciones estructurales utilizando los kits de preparación de muestras de Bionano, el sistema Saphyr™ y el software.

Características del Sistema Saphyr™:

  • Detección de Variantes Genómicas: Detecta variantes genómicas que a menudo son pasadas por alto por otras tecnologías.
  • Resolución y Sensibilidad: Identifica variantes con una sensibilidad superior al 90% para tamaños específicos de variaciones estructurales.
  • Amplias Aplicaciones: Desde el análisis de ADN germinal hasta el análisis de cáncer, Saphyr™ proporciona datos detallados y precisos​

Aplicaciones del Sistema Saphyr™

Cáncer: Mejora la caracterización de tumores mediante la detección de reordenamientos genómicos específicos

Enfermedades Genéticas Raras: Permite el diagnóstico preciso de enfermedades raras mediante el análisis de karyotipos y números de copia​

Investigación de la Genómica del Cáncer y las Enfermedades Genéticas: Avanza en el descubrimiento y la comprensión de variaciones genómicas estructurales

Rendimiento del Sistema Saphyr™ por Aplicación

Los detalles de rendimiento de Saphyr™ varían según la aplicación y el pipeline de análisis utilizado.

APLICACIÓNANÁLISIS DE ADN GERMINALANÁLISIS DE CÁNCER
Datos recolectados400 Gbp1.5 Tbp
Configuración de cobertura100x400x
Cobertura efectiva80x300x
Frecuencia de alelo variante50%>5%
Pipeline de análisisEnsamblaje de novoAnálisis de variantes raras
Rendimiento (tamaño) por tipo de variante*  
Inserciones>500 pb>5 kpb
Deleciones>700 pb>7 kpb
Expansión / Contracción de Repeticiones Estables>500 pb>5 kpb
Duplicaciones>30 kpb>150 kpb
Translocaciones>70 kpb>70 kpb
Inversiones>30 kpb>70 kpb

*El rendimiento mostrado es >90% de sensibilidad.

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