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Coincidencia genética de próxima generación utilizando tecnología de captura híbrida
Una nueva metodología de tubo único para la preparación de la biblioteca que agiliza el flujo de trabajo de laboratorio y permite la captura completa de los genes HLA, con la oportunidad de contenido expansible dirigido a genes adicionales relacionados con el trasplante.
El ADN genómico se une inmediatamente a las perlas y posteriormente se fragmenta e indexa, lo que permite una agrupación más temprana. Este flujo de trabajo optimizado permite una mayor flexibilidad de la muestra al tiempo que reduce el riesgo de confusión y contaminación de la muestra.
Muchas de las químicas actuales basadas en amplicones utilizadas para la tipificación de HLA requieren la configuración de múltiples reacciones de PCR de largo alcance. Los pasos posteriores de limpieza individual, normalización y fragmentación requieren un uso excesivo de la punta y la placa. Después de la etiquetado y la indexación, los fragmentos de la biblioteca se limpian y se seleccionan los tamaños usando perlas magnéticas. Las bibliotecas se agrupan en un solo tubo donde las regiones de interés se hibridan y se capturan utilizando sondas. Después de un enriquecimiento final y una limpieza del cordón magnético, las bibliotecas preparadas se cuantifican y desnaturalizan antes de cargarlas en un instrumento de secuenciación Illumina.
Captura completa de todas las regiones exónicas e intrónicas, así como las UTR circundantes.
* Basado en TruSight HLA v2
La tecnología de captura va más allá de las limitaciones de la PCR de largo alcance, donde las químicas actuales de amplicones a menudo luchan por amplificar el Exón 1 en DRB y DPB1, debido al largo intrón entre Exón 2. El uso de sondas para capturar todo el gen proporciona una secuenciación completa del gen HLA.
Un componente vital del ensayo es el software. AlloSeq ™ Assign® es la próxima generación del conocido software Assign®. Se ha desarrollado para optimizar el análisis de datos para el nuevo ensayo de captura.
Entendemos la importancia de un software fácil de usar y nos esforzamos por proporcionar un software intuitivo y fácil de usar sin comprometer las características analíticas.
