Detalles del producto

El QIAamp DNA Host-Free Microbiome Kit aísla selectivamente el ADN microbiano en muestras con abundante ADN del hospedero, como tejidos, fluidos corporales e hisopos, facilitando un análisis metagenómico más preciso gracias a la eficiente depleción de ácidos nucleicos del hospedero. Este kit proporciona ADN bacteriano de alto rendimiento, ideal para secuenciación metagenómica y compatible con aplicaciones como qPCR, dPCR y otras técnicas moleculares.

Características principales

• Depleción selectiva del ADN del huésped, resultando en ADN bacteriano purificado
• Lisis bacteriana optimizada mediante métodos mecánicos y químicos
• Extracción de ADN de alta calidad, ideal para mejorar lecturas en metagenómica
• Protocolo simple y eficiente con reactivos listos para usar

Procedimiento

1. La muestra se trata con una solución de depleción que degrada selectivamente los ácidos nucleicos del huésped, manteniendo intactas las bacterias.
2. Las bacterias se rompen con tubos PowerBead Pro y buffer de lisis.
3. Los lisados se transfieren a columnas QIAamp UCP Mini, donde los ácidos nucleicos microbianos se unen a membranas de sílica.
4. Dos soluciones de lavado eliminan los contaminantes.
5. El ADN microbiano purificado se eluye con agua libre de ARNasa y queda listo para aplicaciones posteriores.

Aplicaciones compatibles

• Secuenciación metagenómica (shotgun)
• Análisis del microbioma
• Estudios de enfermedades infecciosas
• qPCR, dPCR
• Secuenciación de genes 16S rRNA

Datos de desempeño y figuras

Figura 1. Depleción eficiente del ADN huésped y mejor recuperación del ADN bacteriano

El ADN fue aislado de omaso bovino utilizando el QIAamp DNA Host-Free Microbiome Kit y su predecesor QIAamp DNA Microbiome Kit. El nuevo kit eliminó eficientemente el ADN huésped y permitió extraer aproximadamente 6 veces más ADN bacteriano.

El ADN total fue cuantificado con fluorometría (Qubit™) y el ADN bacteriano mediante qPCR 16S rRNA usando el kit QuantiNova SYBR Green.

Figura 2. Comparación con kits alternativos: más ADN bacteriano, mejor depleción del ADN hospedero

Se comparó el QIAamp DNA Host-Free Microbiome Kit con kits de los proveedores Z y M en omaso bovino. El kit de QIAGEN mostró un 95% de contenido bacteriano frente a 82% (Z) y 60% (M).

El ADN fue medido con Qubit™ y qPCR 16S rRNA (QuantiNova SYBR Green).

Figura 3. Mayor recuperación de ADN bacteriano en hisopos bucales frente a proveedores alternativos

El ADN fue extraído de hisopos bucales (OmniSwab) de tres donantes. El kit QIAamp DNA Host-Free Microbiome aisló más ADN bacteriano que otros kits, incluido su predecesor.