AmpliSeq for Illumina Focus Panel

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Panel de investigación dirigido que analiza 52 genes relevantes para tumores sólidos, compatible con muestras de ADN y ARN.

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AmpliSeq for Illumina Focus Panel

Panel de investigación dirigido que analiza 52 genes relevantes para tumores sólidos, compatible con muestras de ADN y ARN.

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Descripción

El AmpliSeq for Illumina Focus Panel es un ensayo de resecuenciación dirigido que permite el análisis de biomarcadores en 52 genes con relevancia conocida para tumores sólidos. Este panel, que combina la preparación de bibliotecas basada en la tecnología de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de AmpliSeq y la secuenciación por síntesis (SBS) de Illumina, ofrece una solución integrada para la investigación tanto de ADN como de ARN. El panel está diseñado para detectar mutaciones somáticas con una frecuencia tan baja como el 5%, y es compatible con muestras de alta calidad y tejido fijado en formalina e incluido en parafina (FFPE). Con un flujo de trabajo optimizado que permite preparar bibliotecas listas para secuenciar en un solo día, el AmpliSeq for Illumina Focus Panel es una herramienta poderosa para la investigación de cáncer, ofreciendo resultados precisos y ahorrando tiempo y esfuerzo en el diseño y optimización de paneles.

Más información: https://www.illumina.com/products/by-type/sequencing-kits/library-prep-kits/ampliseq-focus-panel.html

Especificaciones técnicas

Parámetro Datos
Tiempo Total del Ensayo 5-6 horas (solo preparación de bibliotecas; no incluye cuantificación, normalización o tiempo de agrupamiento)
Tipo de Cáncer Tumores sólidos
Especificaciones de Contenido 52 genes objetivo para ADN y ARN
Descripción Análisis de investigación somática en 52 genes asociados con cáncer de tumores sólidos
Tiempo de Participación Activa < 1.5 horas
Cantidad de Entrada 1–100 ng (10 ng recomendados por grupo)
Instrumentos Compatibles MiSeq System, iSeq 100 System, MiSeqDx en modo investigación, MiniSeq System
Mecanismo de Acción PCR multiplexado
Método Secuenciación dirigida de ADN, Secuenciación de amplicones, Secuenciación dirigida de ARN
Multiplexado 96 combinaciones de índices duales
Tipo de Ácido Nucleico ADN, ARN
Número de Amplicones 553 en total (269 en el grupo de ADN, 284 en el grupo de ARN)
Tipos de Muestras Especializadas Tejido FFPE
Categoría de Especies Humano
Tecnología Secuenciación
Clase de Variantes Polimorfismos de nucleótido único (SNPs), Fusiones génicas, Variantes somáticas, Inserciones-deleciones (indels), Variantes de número de copias (CNVs)

Productos & complementos

Cuadro de Productos (Variantes):

Producto Número de Catálogo Descripción
AmpliSeq™ Focus Panel for Illumina® 20019164 Panel dirigido de ADN y ARN que analiza SNVs, indels y fusiones génicas.
AmpliSeq™ for Illumina® Focus Panel MiSeq Kit 20024183 Kit de MiSeq para preparación de bibliotecas y secuenciación utilizando el panel AmpliSeq Focus.

Cuadro de Productos Complementarios:

Producto Número de Catálogo Descripción
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina® 20019101 Incluye reactivos para preparar 24 bibliotecas. Requiere compra adicional de índices AmpliSeq.
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina® 20019102 Incluye reactivos para preparar 96 bibliotecas. Requiere compra adicional de índices AmpliSeq.
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina® 20019103 Incluye reactivos para preparar 384 bibliotecas. Requiere compra adicional de índices AmpliSeq.
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples) 20019104 Incluye 24 índices suficientes para etiquetar 24 muestras. Requiere compra adicional de AmpliSeq Library PLUS.
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples) 20031676 Incluye cuatro conjuntos de índices AmpliSeq CD para Illumina, Set A-D.
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina® 20022654 Incluye mezcla de reacción y mezcla enzimática para convertir ARN total en cDNA.
AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA 20023378 Incluye 24 reacciones para preparar ADN a partir de muestras de tejido FFPE no teñidas.
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina® 20019171 Incluye cuentas y reactivos para normalización de bibliotecas al preparar muestras con AmpliSeq Library PLUS.

Lista de genes

DNA Pool RNA Pool
AKT1 ABL1
ALK EGFR
AR ALK
BRAF AKT3
CCND1 AXL
CDK4 BRAF
CDK6 DDR2
CTNNB1 ETV5
DDR2 FGFR2
EGFR ERBB2
ERBB3 ERG
ERBB4 ETV1
ESR1 ETV4
FGFR1 FGFR1
FGFR2 FGFR3
FGFR3 MET
FGFR4 ETV5
GNA11 GNA11
GNAQ GNAQ
HRAS HRAS
IDH1 IDH1
IDH2 IDH2
JAK1 JAK1
JAK2 JAK2
JAK3 JAK3
KIT KIT
KRAS KRAS
MAP2K1 MAP2K1
MAP2K2 MAP2K2
MET MET
MTOR MTOR
MYC MYC
MYCN MYCN
NRAS NRAS
PDGFRA PDGFRA
PIK3CA PIK3CA
RAF1 RAF1
RET RET
ROS1 ROS1
SMO SMO
PPARG PPARG
NTRK1 NTRK1
NTRK2 NTRK2