TruSight Oncology 500

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Ensayo NGS integral para el perfil genómico completo de muestras FFPE, que cubre variantes clave de ADN y ARN, así como firmas genéticas importantes.

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TruSight Oncology 500

Ensayo NGS integral para el perfil genómico completo de muestras FFPE, que cubre variantes clave de ADN y ARN, así como firmas genéticas importantes.

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Descripción

TruSight Oncology 500 (TSO 500) es un ensayo de secuenciación de próxima generación (NGS) que permite la realización de perfiles genómicos completos (CGP) de muestras de tejido FFPE. Este panel integral abarca 523 genes para evaluar todos los tipos de variantes de ADN y ARN, incluidas variantes de nucleótido único (SNV), variantes en el número de copias (CNV), inserciones-deleciones (indels), fusiones de genes, así como firmas genéticas clave como inestabilidad de microsatélites (MSI), carga mutacional tumoral (TMB) y deficiencia de recombinación homóloga (HRD).

El TSO 500 ofrece resultados precisos utilizando una química de captura por hibridación avanzada y potentes herramientas bioinformáticas. Su flujo de trabajo es eficiente y puede integrarse fácilmente en laboratorios que buscan realizar perfiles genómicos completos internamente, con un tiempo total de análisis de 4 a 5 días. Además, TSO 500 está disponible en configuraciones de alto rendimiento para aumentar la capacidad de procesamiento.

Más información: https://www.illumina.com/products/by-type/clinical-research-products/trusight-oncology-500.html

Especificaciones técnicas

Parámetro Especificación
Tiempo de ensayo (Assay time) 4–5 días desde la muestra hasta los resultados
Capacidad de automatización Robots de manipulación de líquidos
Detalles de automatización Explora los métodos de automatización disponibles
Tipo de cáncer Pan-cáncer, Tumor sólido
Especificaciones de contenido Secuenciación dirigida de ADN de 523 genes y ARN de 55 genes, tamaño total del panel de 1.94 Mb. Incluye medición de MSI y TMB. El kit opcional TruSight Oncology 500 HRD (no disponible en Japón) incluye la cobertura de ~25K SNPs para evaluar la deficiencia de recombinación homóloga a través de un puntaje de inestabilidad genómica (LOH+TAI+LST) impulsado por Myriad Genetics.
Descripción Ensayo que permite el perfil genómico completo de tejido FFPE y se ejecuta en el NextSeq 550 System o NextSeq 550Dx en modo de investigación, pudiendo procesar hasta ocho muestras a la vez.
Tiempo de participación manual (Hands-on time) ~2.5 horas para flujo de trabajo automatizado, ~10.5 horas para flujo de trabajo manual
Cantidad de entrada 40 ng de ADN y/o 40 ng de ARN
Instrumentos compatibles NextSeq 550 System, NextSeq 550Dx en modo de investigación, NextSeq 500 System
Método Secuenciación dirigida de ADN, Secuenciación dirigida de ARN, Enriquecimiento dirigido
Multiplexado Hasta 8-plex
Tipo de ácido nucleico ADN, ARN
Tipos de muestras especializadas Tejido FFPE
Categoría de especies Humano
Tecnología Secuenciación
Clases de variantes Fusiones de genes, Variantes de transcritos, Variantes de nucleótido único (SNVs), Inserciones-deleciones (indels), Variantes en el número de copias (CNVs), Pérdida de heterocigosidad (LOH), Variantes somáticas, Transcritos novedosos, Polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), Variantes estructurales

Versiones del producto

Manual prep

Número de Catálogo Producto
20076480 TruSight Oncology 500 HRD Kit (24 samples)
20028213 TruSight Oncology 500 DNA Kit (48 samples)
20028214 TruSight Oncology 500 DNA Kit, For Use with NextSeq (48 samples)
20028215 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle, (16 indexes, 24 samples)
20028216 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle, for use with NextSeq (16 indexes, 24 samples)
20032624 TruSight Oncology 500 DNA Kit plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 Samples)
20032625 TruSight Oncology 500 DNA Kit for Use with NextSeq plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 Samples)
20032626 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle plus Velsera interpretation report (16 indexes, 24 Samples)
20032627 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Kit for Use with NextSeq plus Velsera interpretation report (16 indexes, 24 Samples)

Automation

Número de Catálogo Producto
20045504 TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit (16 indexes, 64 Samples)

Cuadro de Genes Relevantes en Diferentes Tipos de Cáncer

Pan-cancer: BRAF, NTRK1, NTRK2, NTRK3, RET, MSI, TMB
Tipo de Cáncer Genes con Biomarcadores Significativos * Número Total de Genes†
Breast BRCA1, BRCA2, ERBB2, ESR1, PALB2, PIK3CA 180
Colorectal ERBB2, KRAS, NRAS 166
Bone EGFR, ERG, ETV1, ETV4, EWSR1, FEV, FLI1, FUS, H3F3A, HEY1, IDH1, MDM2, NCOA2, SMARCB1 140
Lung ALK, EGFR, ERBB2, KRAS, MET, NUTM1, ROS1 223
Melanoma KIT, NRAS, ROS1 172
Ovarian BRCA1, BRCA2, FOXL2 149
CNS‡ APC, ATRX, CDKN2A, CDKN2B, EGFR, H3F3A, HIST1H3B, HIST1H3C, IDH1, IDH2, MYCN, PTCH1, RELA, TERT, TP53 140
Prostate AR, ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDK12, CHEK1, CHEK2, FANCL, FGFR2, FGFR3, PALB2, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD54L 151
Thyroid HRAS, KRAS, NRAS, RET, TERT 165
Uterine and Cervical BRCA2, EPC1, ERBB2, ESR1, FOXO1, GREB1, JAZF1, NCOA2, NCOA3, NUTM2A, NUTM2B, PAX3, PAX7, PHF1, POLE, SMARCA4, SUZ12, TP53, YWHAE 138
Other Solid Tumors ALK, APC, ARID1A, ASPSCR1, ATF1, ATIC, BAP1, BCOR, BRCA1, BRCA2, CAMTA1, CARS, CCNB2, CDK4, CDKN2A, CIC, CITED2, CLTC, COL1A1, COL6A3, CREB1, CREB3L1, CREB3L2, CSF1, CTNNB1, DDIT3, DDX3X, DNAJB1, DUX4, EED, EGFR, ERBB2, ERG, ETV1, ETV4, ETV6, EWSR1, FEV, FGFR2, FGFR3, FLI1, FOXL2, FOXO1, FOXO4, FUS, GLI1, HEY1, HGF, HMGA2, IDH1, KRAS, LEUTX, MAML3, MDM2, MYB, MYOD1, NAB2, NCOA2, NF1, NFATC2, NFIB, NR4A3, NRAS, NUTMI, NUTM2A, NUTM2B, PALB2, PATZ1, PAX3, PAX7, PDGFB, PDGFRA, PRKACA, PRKD1, RANBP2, ROS1, SDHA, SDHB, SDHC, SDHD, SMARCB1, SS18, SSX1, SSX2, SSX4, STAT6, SUZ12, TAF15, TCF12, TERT, TFE3, TFEB, TFG, TP53, TPM3, TPM4, TRAF7, TSPAN31, VGLL2, WT1, WWTR1, YAP1, YWHAE, ZC3H7B 152

* Genes with biomarkers of significance linked to current drug labels or guidelines.
† Genes with biomarkers of potential significance based on presence in clinical trials.
‡ CNS, central nervous system.

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