El Urinary Pathogen ID/AMR Panel (UPIP) es un panel de investigación de secuenciación de nueva generación (NGS) que permite la detección y cuantificación de más de 170 uropatógenos responsables de infecciones del tracto urinario (ITU) y coinfecciones, cubriendo más de 3700 marcadores y sus alelos asociados con resistencia antimicrobiana (AMR).

Características principales

• Detección simultánea de más de 120 bacterias, 35 virus, 14 hongos, 4 parásitos y 27 patógenos de transmisión sexual en menos de 24 horas usando MiniSeq y el kit de reactivos rápidos.
• Enriquecimiento de regiones objetivo de uropatógenos a partir de diversas muestras del huésped y del entorno.
• Detección de uropatógenos poco comunes, difíciles de cultivar y frecuentemente pasados por alto.
• Supera a la metagenómica de escopeta y los métodos convencionales de cultivo de orina.

Flujo de trabajo simplificado

El kit de enriquecimiento Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Panel incluye todos los reactivos para la preparación de librerías y enriquecimiento, índices y sondas de panel para la tagmentación en bolas, seguido de un paso de hibridación único. La integración del kit con la extracción de ADN, la secuenciación y el análisis de datos Explify UPIP proporciona un flujo de trabajo completo para la detección y la identificación de infecciones urinarias (ITUs).

Especificaciones

• Tiempo de ensayo: < 9 horas para la preparación de librerías y enriquecimiento
• Capacidad de automatización: Compatible con robots de manejo de líquidos
• Contenido: Detecta más de 120 bacterias, 14 hongos, 35 virus, 4 parásitos (incluidos 27 patógenos de transmisión sexual) y más de 3700 marcadores de resistencia antimicrobiana
• Tiempo de manipulación: < 2 horas para la preparación de librerías y enriquecimiento
• Cantidad de entrada: Basado en volumen (no dependiente de la concentración)
• Instrumentos compatibles: MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx en modo de investigación, MiniSeq System, NextSeq 550Dx en modo de investigación
• Mecanismo de acción: Tagmentación en bolas seguida de un paso de hibridación único
• Método: Secuenciación de ADN dirigida, enriquecimiento dirigido
• Multiplexación: Hasta 384 muestras en una sola corrida con índices duales únicos
• Tipo de ácido nucleico: ADN
• Tipos de muestra compatibles: ADN extraído de muestras clínicas de investigación urinaria humana y otras muestras relacionadas con vigilancia, como aguas residuales
• Tipo de muestra especializada: No compatible con FFPE
• Categoría de especies: Humanos, virus, bacterias
• Detalles de especies: Hongos y parásitos

Aplicaciones

El Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit es ideal para la detección e identificación de más de 170 uropatógenos y más de 3700 marcadores de resistencia antimicrobiana, desde diversas muestras como investigación clínica urinaria, muestras ambientales y otros tipos de muestras.