TruSight Hereditary Cancer Panel

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Panel de secuenciación dirigido que evalúa mutaciones germinales en 113 genes y 125 SNPs relacionados con el riesgo genético de cáncer, optimizado para un flujo de trabajo rápido y una alta precisión en la detección de variantes.

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TruSight Hereditary Cancer Panel

Panel de secuenciación dirigido que evalúa mutaciones germinales en 113 genes y 125 SNPs relacionados con el riesgo genético de cáncer, optimizado para un flujo de trabajo rápido y una alta precisión en la detección de variantes.

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Descripción

El TruSight Hereditary Cancer Panel es un panel de secuenciación dirigido diseñado para evaluar mutaciones germinales en 113 genes y 125 SNPs asociados con el riesgo de predisposición genética al cáncer. Este panel fue desarrollado en colaboración con expertos en genómica del cáncer y ofrece un enfoque exhaustivo para la evaluación de variantes genéticas que influyen en la susceptibilidad a diferentes tipos de cáncer, incluyendo mama, colon, ovario y gástrico. Utilizando la química de captura híbrida integrada con Illumina DNA Prep with Enrichment, este panel asegura una excelente uniformidad de cobertura para la detección precisa de variantes como SNVs, indels y CNVs. Compatible con los sistemas de secuenciación de sobremesa de Illumina, permite una flexibilidad en la productividad, permitiendo procesar de 2 a 256 muestras en un solo experimento, con un flujo de trabajo rápido que va desde la obtención de ADN hasta la generación de datos en aproximadamente 48 horas.

Más información: https://www.illumina.com/products/by-type/clinical-research-products/trusight-cancer-hereditary.html

Especificaciones técnicas

Parámetro Datos
Sistemas de Secuenciación Compatibles iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (modo investigación), NextSeq 550, NextSeq 550Dx (modo investigación)
Tamaño de Panel 403 kb, 113 genes, 125 SNPs
Número de Sondas 10,341 sondas de oligonucleótidos
Tipo de Muestra ADN genómico, sangre o saliva
Entrada de ADN 50-1000 ng
Duración Total del Ensayo ~48 horas desde la obtención del ADN hasta la generación de datos
Tiempo de Preparación de Librerías 6.5 horas (2 horas de participación activa)
Productividad de Muestras 2 a 256 muestras por experimento, con una cobertura promedio de 300×
Muestras por Tubo 8 enriquecimientos (hasta 12 muestras por enriquecimiento)
Variantes Detectadas SNVs, indels, CNVs
Especificidad de la Muestra Sangre, Saliva
Tecnología Secuenciación

Productos complementarios

Library Prep (5 versiones)

Producto Número de Catálogo Descripción
TruSight Hereditary Cancer – Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions) 20029551 Oligos de enriquecimiento para 8 reacciones de enriquecimiento.
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples) 20025524 Incluye reactivos para preparar y enriquecer 96 librerías.
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples) 20025523 Incluye reactivos para preparar y enriquecer 16 librerías.
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples) 20025520 Incluye reactivos para preparar 96 librerías sin enriquecimiento.
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples) 20025519 Incluye reactivos para preparar 16 librerías sin enriquecimiento.

Index Adapters (8 versiones)

Producto Número de Catálogo Descripción
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) 20091654 Set de índices UD para 96 muestras.
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) 20091656 Set de índices UD para 96 muestras.
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) 20091658 Set de índices UD para 96 muestras.
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) 20091660 Set de índices UD para 96 muestras.
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) 20027213 Índices UD para 96 muestras.
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) 20027214 Índices UD para 96 muestras.
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) 20042666 Índices UD para 96 muestras.
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) 20042667 Índices UD para 96 muestras.

Reagents (10 versiones)

Producto Número de Catálogo Descripción
iSeq 100 i1 Reagent v2 (300-cycle) 20031371 Reagentes para 300 ciclos.
iSeq 100 i1 Reagent v2 (300-cycle) 4 pack 20031374 Paquete de 4 reagentes para 300 ciclos cada uno.
iSeq 100 i1 Reagent v2 (300-cycle) 8 pack 20040760 Paquete de 8 reagentes para 300 ciclos cada uno.
MiSeq Reagent Micro Kit v2 (300-cycles) MS-103-1002 Reagentes para hasta 325 ciclos de secuenciación.
MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles) MS-102-2002 Kit de reagentes para 300 ciclos por kit.
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle) MS-102-3003 Kit de reagentes para 625 ciclos de secuenciación.
MiniSeq Mid Output Kit (300-cycles) FC-420-1004 Kit de reagentes para 300 ciclos de secuenciación.
MiniSeq High Output Reagent Kit (300-cycles) FC-420-1003 Kit de reagentes para 300 ciclos de secuenciación.
NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (300 Cycles) 20024905 Kit de reagentes para 300 ciclos de secuenciación.
NextSeq 500/550 High Output Kit v2.5 (300 Cycles) 20024908 Kit de reagentes para 300 ciclos de secuenciación.

Accessory Products (1 versión)

Producto Número de Catálogo Descripción
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions) 20018706 Incluye reagentes para procesar muestras de sangre con el Illumina DNA Prep with Enrichment.

Cuadro de Genes Relevantes en Diferentes Tipos de Cáncer

Grupo 1 Grupo 2 Grupo 3 Grupo 4
ACD DIS3L2 GREM1 PIK3CA
AIP EPCAM HOXB13 PMS2
AKT1 ERCC1 KIF1B POLD1
APC ERCC2 KIT SMAD4
ATM ERCC3 LZTR1 SMARCA4
BAP1 ERCC4 MAX SMARCB1
BARD1 ERCC5 MEN1 SMARCE1
BLM FAM175A MET SPINK1
BMPR1A FANCA MITF SPRED1
BRCA1 FANCB MLH1 STK11
BRCA2 FANCC MRE11A SUFU
BRIP1 FANCD2 MSH2 TERF2IP
CASR FANCE MSH3 TMEM127
CDC73 FANCF MSH6 TP53
CDH1 FANCG MUTYH TSC1
CDK4 FANCI NBN TSC2
CDKN1B FANCL NF1 VHL
CDKN2A FANCM NF2 WT1
CEBPA FH NSD1 XPA
CHEK2 FLCN NTHL1 XPC
CTRC GALNT12 PALB2 XRCC2
DDB2 GATA2 PDGFRA SDHA
DICER1 GPC3 PHOX2B SDHB
SDHC SDHD

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